После утверждения  кандидатуры В.В.Сороки в Министерстве образования и в Новгородском обкоме КПСС 26.11.1982 года он был назначен приказом Министра образования на долж­ность ректора НПИ. Через год его избрали на Учёном Совете НПИ на 5-летний срок, а в 1988 году на второй 5-летний срок. В итоге Владимир Васильевич был ректором НПИ 11 лет вплоть до создания Новгородского Государственного Университета (НовГУ), первым ректо­ром которого он и стал в 1993 году. В общей сложности Владимир Васильевич проработал ректором в Новгороде 15 лет.

Позже в интервью газете «Политехник» Владимир Васильевич говорил: «Приняв инсти­тут, стоящий на коленях, я стремился максимально полно использовать свои способности, знания и опыт для решения главной задачи по обеспечению высокого престижа НПИ». Уже в 1984 году по приказу ректора НПИ переходит на новую структуру - общетехнический фа­культет (ОТФ), что требует огромных организационных изменений, впервые вводится про­грамма непрерывной физико-математической подготовки студентов на всех специальностях, открывается факультет общественных профессий (ФОГТ), новые специальности, в НПИ со­здаётся учебно - научно-производственный комплекс (УНПК), Центр научно-технического творчества молодёжи (НТТМ), библиотечно-информационный центр (БИЦ), хозрасчётный центр научно-технических услуг «Политех», отдел международных связей (ОМС), открыва­ются подготовительные курсы. В 1984 году в институте выходит первый номер газеты «Поли­техник», превратившийся впоследствии в «Новгородский Университет», создается музей НПИ, а затем музей Новгу.  Инженерно-строительный факультет переезжает в новый корпус, построенный студенческими строительными отрядами (ССО), выросшие затем в Центр до­вузовской подготовки в НовГУ. Открывается студенческое кафе, спортивно-оздоровительный лагерь «Политех» в Песочках, профессиональный клуб мотогонщиков «Паллада», баскет­больная команда девушек «Политех» впервые стала чемпионом России.

При нём в институте был создан первый в России сана­торий -профилакторий, бесплатная медицинская и стоматологическая помощь, водолечебниц­а. Введено льготное питание для преподавателей и студентов: бесплатные или с 50% оплатой абонементы, а для ректората и профессоров - представительские талоны. Пре­подаватели получают бесплатно квартиры, распределяются земельные участки, впервые по­является возможность через институт приобрести личные автомобили. В учебной и научной деятельно­сти появляются АСУ, САПР, открывается новая специальность ПОВТ (программное обеспече­ние вычислительной техники и автоматизированных систем), лаборатория техниче­ского сту­денческого творчества (ТОСТ), социологическая лаборатория, гуманитарный фа­культет, вы­ставочный зал. В это время создается  Новгородское отделение Петровской Акаде­мии наук и искусства, а также Новгородский филиал  исследовательского Центра качества подготовки специалистов при Комитете по Высшей школе, продолжаются работы по созда­нию НовГУ, колледжей и филиалов НПИ, а также Новгородского Центра науки и образования, кото­рые должны войти в состав АО «Новобрнаука». Благодаря огромным организаторским способностям Владимира Васильевича, умению ставить и решать различного рода задачи, диктуе­мые обстоятель­ствами,  поддержке любых деловых предложений, за 11 лет НПИ из првовинциаль­ного ВУЗа превратился в инсти­тут, известный своими новациями не только в СССР, но и за рубе­жом. Владимир Васильевич был доброжелателен и внимателен к коллегам и всем, кто к нему обращался, он сумел завоевать их доверие,  объединить и настроить коллектив на работу так, что    Политехнический институт стал той основой, на которой впоследствии вырос НовГУ, Многое из того, что было впервые введено в НПИ получило свое развитие в Нов­ГУ.

В октябре 1990 года в «Отчёте о деятельности администрации» на конференции трудо­вого коллектива НПИ Владимир Васильевич впервые предложил рассмотреть вопрос о воз­можности объединения ВУЗов Новгорода в Университет. Несколькими днями позже на расши­ренном заседании Совета Ректоров Новгородских ВУЗов (политехнического, педагогиче­ского, сельскохозяйственного) совместно с представителями Главной Государственной инспек­ции учебных заведений при Госкомитете СССР по народному образованию Владимир Васи­льевич впервые изложил свою концепцию создания НовГУ и программу поэтапной интегра­ции ВУ­Зов.  Председателем Ученого Совета НПИ и ректоратом   при поддержке руководства Новгорода и Новгородской области, председателем Госкомвуза России В.Г.Кинелевым была проведена громадная  документальная и  подготовительная  работа по ор­ганизационному устройству университета.

И 30 июня 1993 года Председателем Совета Министров Правительства Росийской федерации В.С.Черномырдиным было подписано Постановление  № 624 «О созда­нии Новгородского государственного университета», а 30 июня 1994 года  Председатель Го­судрственного комитета Российской Федерации  приказом  №14-4 утвердил ректором Новго­родского государственного университета Сороку В.В., доктора физико-математических наук, профессора.  Примечательно, что  даты принятия  этих очень значимых  для университета до­кументов  совпали с дем рождения Сороки В.В. - 30 июня. Начинается активная и кропотливая работа по созданию новых структурных подразделений, факультетов, кафедр, лабораторий и т.д. нового университета.

Выписка из приказа: №39 от 11.10.93г. «О структуре, штатном расписании Института педагогического образования НовГУ».

Сентябрь 1993г. - открытие «Управления документооборота и офисных технологий; ноябрь 1993 г. - создано Управление инноваций и внедрений АО «Новгородтехнопарк»; создан Центр валеологии НовГУ; декабрь 1993г. - впервые в России в высшем учебном заведении открыт ресторан «Пармская обитель».

В январе 1995г. -     состоялось открытие юридического ф-та НовГУ;

№360 от 09.06.95г. «Об организации в составе НовГУ Института медицинского образова­ния».июнь 1995г.     -    впервые в вузе России создано охранное агентство «Хантер».В 1995 году на НГТРК «Славия» за создание солидного имиджа  Университета, высокий научный потенци­ал, новаторство и      масштабность связей» Владимир Васильевич был назван «Человеком года».

В феврале   1995 г. в университете прошёл  Всероссийский   семинар  по докладу В.В.Со­роки  «Основные   тенденции   и   принципы   формирования   высшего   и специального сред­него образования в регионах России» (на примере Новгородской области )Участники  семинара:  заместитель  председателя  Госкомитета  РФ     по  высшему  об­разованию  В.М. Жураковский, заместитель министра Министерства образования РФ В.А. Болотов, предсе­датель комитетаобразования Новгородской области В.Н. Аверкин, ректора и проректора вузов России от Магадана и Якутии до Краснодара и Санкт-Петербурга.

№539 от 03.09.96 г. «Об организации в составе НовГУ Гуманитарного Института»;

№569 от 16.09.96 г. «О создании Управления среднего профессионального образования НовГУ»;

Февраль 1996 г. - НовГУ принят в Международную академию по экологии и безопасной жизнедеятельности; создан первый Докторский Совет; прошёл приём  в аспирантуру,

№108 от 25.02.97г. « Об образовании академии сельского хозяйства и природных ресурсов в составе НовГУ»;

№530 от 30.07.97г. «О структурных изменениях в связи с интеграцией Нов­ГУ и НГСХА». «Об образовании института экономики и менеджмента (ИЭиМ) в составе Нов­ГУ». 

В сентябе 1997 г.  создано объединённое управление НовГУ по международной деятельно­сти.

 Вышел первый номер журнала «Вести НовГУ», «Естественные и технические науки»; позже вышел первый номер ху­дожественного - публицис­тического альманаха «Чело».

С 1983 года по 1998 - 15 лет работы в должности вначале ректора Новгородского политех­нического института, а затем Новгородского Государственного Университета требовали от рек­тора много сил и здоровья. Он любил и умел работать. Ещё в начале своей служебной карьеры в интервью газете «Новгородский комсомолец» 31 декабря 1985 года Владимир Васильевич гово­рил: «Я привык серьёзно относится к своему делу. Люблю его, с ним связаны все мои жизнен­ные интересы. Без работы себя не мыслю: она для меня даже не долг, а первая потребность.»

На долю Владимира Васильевича выпало тяжелое время перестройки в государстве и обще­стве. Начало 90-х годов - время распада великого Советского Союза, переход к новым принци­пам рыночной экономики, и как следствие - развал старой системы образования.

Останов­ка финансирования многих статей бюджета университета,
задержка и несвоевременные выплаты зарплаты преподавателям и стипендий студентам, всё возрастающее состояние   неудовлетворенности в обществе, естественно осложняли и без того трудный процесс организации университета. За 15 лет работы рабочий день ректора постепенно увеличивался: с 8 часов  до 10-12 часов; рабочая неделя со­ставляла 6 -7 дней. Последние 4 самые трудные года Владимир Васильевич не был в отпуске. Конечно, в огромной организационной работе всегда рядом с ним была его «команда» и хотя члены её за эти 15 лет меня­лись, все они были его единомышленниками, помогали и под­держивали ректора в его новаторской деятельности. Огромное содействие Владимиру Васильевичу ока­зывали председатель Госкомвуза РФ В.Г. Кинелёв, его заместители, начальники управлений, Губер­натор Новгородской области М.М. Прусак, руководители города В.А. Корсунов и Н.Н. Гра­жданкин, руководители город­ского и областного комитетов по образованию, проректора, рек­тора институтов НовГУ, деканы, заведующие кафедр, весь профессорско - преподавательский состав и сотрудники НовГУ.

Однако был один лидер - это Владимир Васильевич Сорока, на плечи которого лёг такой не­объятный груз, видимо, выдер­жать который один человек не мог.

В 1997 университет благополучно прошёл  первую аккредита­цию и проверку КРУ. Наконец-то в январе 1998 года Владимир Васильевич уезжает в отпуск в Сочинский санаторий.

 В Сочи тепло и солнечно,   Владимир Васильевич   отдыхает с удоволь­ствием: много гуляет,  купается, лечится, но не забывает о родном университете.

Сердце остановилось внезапно, утром, на прогулке 6 февраля.

 По распоряжению Губернатора области М.М. Прусака 7 фев­раля самолётом перевозят гроб с телом Владимира Васильевича в Новгород.Торжественно и скорбно провожают Университет и весь Новгород своего первого президента. На   имя руководства НовГУ и семьи Владимира Ва­сильевича     пришло     множество скорбных писем и телеграмм с   соболезнованиями об утра­те, из разных городов России и из-за рубежа.    Похоронен он   был по благословению Архиепи­скопа Новгородского и Старорусского Льва в ограде Варлаамо-Хутынского     Спасо-Преобра­женского монастыря 10 февраля 1998 года.